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| 金草鱼Serpinc1基因克隆及其序列分析 |
| 程一飞1,韦思婷王进千2,姜涛2,黄晨2,张丽1,史丽娜3,刘丽霞2 |
1. 西北民族大学
2. 西北民族大学生命科学与工程学院
3. 定西市渔业技术推广站
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| 摘要 【目的】获取金草鱼Serpinc1基因序列，研究金草鱼与草鱼Serpinc1基因的差异，并预测金草鱼Serpinc1 基因序列的特征及其编码蛋白的高级结构【方法】本研究利用RT-PCR克隆测序技术获得金草鱼Serpinc1基因序列，分析其与草鱼Serpinc1 基因的差异，并通过生物信息学方法预测金草鱼Serpinc1 基因序列的特征及其编码蛋白的高级结构。【结论】结果显示，金草鱼Serpinc1基因与草鱼相比共有4个核苷酸位点发生改变（c.1091T>A、c.1116A>T、c.1176T>G和c.1179C>T），其中仅有1个位点（c.1091T>A）为错义突变，导致第364位缬氨酸（Val）转变为谷氨酸（Glu）。生物信息学预测结果表明，金草鱼Serpinc1基因开放阅读框长度为1353bp，共编码450个氨基酸，分子量为 50.89 kDa，理论等电点为6.58，不稳定指数为34.55，属于不稳定蛋白；编码氨基酸包含20种标准氨基酸，其中亮氨酸最多（10.2 %），而色氨酸（Trp）含量最少（1.3 %）；整条肽链的亲疏水平均值为-0.213，表现为亲水性；包含4个糖基化位点和37个磷酸化位点；蛋白质二、三级结构以α螺旋和无规则卷曲为主。研究结果可为深入研究金草鱼Serpinc1分子结构和功能及其发挥该功能的活性位点的验证奠定了基础，为金草鱼出血性疾病相关分子标记的筛选提供了理论基础。 |
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| 关键词： |
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收稿日期: 2020-02-28;
出版日期: 2020-04-15
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| 基金资助:西北民族大学中央高校基本科研业务费专项资金资助项目;西北民族大学2019年本科生科研创新项目;定西市草牧产业科技研发专项经费资助 |
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通讯作者: 程一飞
E-mail: 15972528524@163.com
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引用本文: |
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程一飞,韦思婷,王进千等. 金草鱼Serpinc1基因克隆及其序列分析[J]. 现代畜牧兽医, 2020, (04): 1-7.
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2020, Vol. 
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