研究旨在明确长顺绿壳蛋鸡肠道菌群结构及功能。健康、体重无差异的20只27周龄长顺绿壳蛋鸡饲养35 d，随机选择4只，分别提取十二指肠、回肠和盲肠内容物的微生物总DNA，对16S rRNA进行高通量测序。结果显示：盲肠OTUs个数最多，其次为回肠，最少为十二指肠。盲肠的Ace指数、Chao-1指数和Shannon指数极显著高于十二指肠和回肠（P<0.01）。回肠的Ace指数和Chao-1指数显著高于十二指肠（P<0.05）。在门水平上，厚壁菌门为十二指肠（97.06%）和回肠（96.36%）的优势菌门；拟杆菌门（62.55%）和厚壁菌门（34.05%）为盲肠的优势菌门。在属水平上，乳杆菌属为十二指肠（94.133%）和回肠（95.273%）的优势菌属；拟杆菌属为盲肠（40.548%）的优势菌属。PICRUSt功能预测显示，肠道微生物基因主要富集于KEGG的新陈代谢（44.74%～49.34%）通路，其中盲肠营养物质代谢相关通路中富集基因相对丰度较高，如氨基酸代谢、能量代谢以及辅因子与维生素代谢等。研究表明，随着长顺绿壳蛋鸡肠道延伸，菌群多样性程度明显增加，且盲肠菌群的营养代谢作用更为活跃。